ICS 11. 220 B 41 GB 中华人民共和国国家标准 GB/T 27518—2011 西尼罗病毒病检测方法 Diagnostic of west nile virus infections 2011-11-21发布 2012-03-01实施 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布 中国国家标准化管理委员会 GB/T27518—2011 前言 本标准按照GB/T1.1一2009给出的规则起草。 本标准由中华人民共和国农业部提出。 本标准由全国动物防疫标准化技术委员会(SAC/TC181)归口。 本标准起草单位:中华人民共和国北京出入境检验检疫局、北京百欧赛地生物工程技术开发中心。 本标准主要起草人:杨秀娟、孙福军、丁若愚、田茵、田睿、王飞、杨静 GB/T27518—2011 西尼罗病毒病检测方法 1范围 本标准规定了西尼罗病毒的反转录聚合酶链反应(ReverseTranscription一PolymeraseChainRe- action,RT-PCR)、蚀斑减少中和试验(PlaqueReductionNeutralizationTest,PRNT)和西尼罗病毒的 分离方法。 本标准适用于易感动物的西尼罗病毒病的检测。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文 件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法 3缩略语 下列缩略语适用于本文件。 ABTSdiammonium2,2-azino-bis(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonate):2,2-连氮基-双-(3-乙基苯 并二氢噻唑啉-6-磺酸)二铵盐 AMV:鸟类成髓细胞白血病病毒(avianmyeloblastosisvirus) BSA:牛血清白蛋白(bovine serumalbumin) CPE:细胞病变效应(cytopathiceffect) cDNA:互补 DNA(complementary DNA) DEPC:焦碳酸乙二酯(diethylpyrocarbonate) DNAdeoxyribonucleic acid:脱氧核糖核酸 dH,O:双蒸水(double distilled water) dNTP:脱氧核苷酸三磷酸(deoxy-ribonucleosidetriphosphate)含有dCTP、dGTP、dATP、dTTP四 种脱氧核糖核苷 EDTA:乙二胺四乙酸(ethylenediaminetetraaceticacid) 6-FAM:6-羧基荧光素(6-carboxyfluorescein) HEPES:羟乙基呱嗪乙硫磺酸(N-2-hydroxyethylpiperazine-N-ethane-sulphonicacid) MEM基础培养基(minima essentialmedium) OligodT:多聚T再加上一小段随机碱基(几个碱基)构成的引物,用于RT-PCR PBS:磷酸盐缓冲生理盐水(phosphatebelancedsolution) PFU:蚀斑形成单位(plaqueformingunits) PRNT:蚀斑减少中和试验(plaquereductionneutralizationtest) RNA:核糖核酸(ribonucleicacid) RNasin:核酸酶抑制剂(RNAenzymeinhibitor) TAE:醋酸盐EDTA(tris-acetate-EDTATris) 1 GB/T27518—2011 Taq酶:耐热DNA聚合酶(thermus aquaticuspolymerase) TAMRA:四甲基罗丹明(carboxytetramethylrhodamine) TRIzol:一种新型总RNA抽提试剂(trizolreagent),可以直接从细胞或组织中提取总RNA Vero细胞:非洲绿猴肾细胞 WNV.西尼罗病毒(westnilevirus) 4试剂 4.1水:符合GB/T6682中一级水的规格,用DEPC处理以除掉RNA酶。 4.2TRIzol试剂或其他等效的商品化RNA抽提试剂。 4.3AMV逆转录酶:20U/uL,一20℃保存,不要反复冻融或温度剧烈变化。 4.45XAMVBuffer:AMV逆转录酶的缓冲液。 4.5F RNasin:20U/uL,一20℃保存,不要反复冻融或温度剧烈变化。 4. 6 Oligo(dT):RT-PCR的引物。 4.7 1oXTagBuffer:Tag酶的缓冲液。 4.8 Taq酶:一20℃保存,不要反复冻融或温度剧烈变化, 4.9dNTP三磷酸脱氧核糖核苷,含dCTP、dGTP、dATP、dTTP各10mmoL/L。 4. 10 琼脂糖:电泳级。 4. 11 三氯甲烷:分析纯。 4.12 异丙醇:分析纯,使用前预冷到一20℃。 4.13 75%乙醇。 4.141 PBS:121℃高压15min后,无菌加人青霉素和链霉素至1000U/mL。 4.15 5TAE:24.2gTris碱、5.7lg冻乙酸、0.5mol/LEDTA(pH8.0)10mL,加水定容至100mL,使 用前作50倍稀释,用盐酸调节pH值至7.5~7.8。 4.16WNV标准毒株、WNV阳性对照与WNV阴性对照。 4.17MEM细胞培养基。 4.18Vero细胞。 4.19 胎牛血清。 4.20细胞维持液:含2%~3%胎牛血清、青霉素和链霉素分别为100U/mL的无菌MEM。 4.21中性红水溶液:中性红粉0.1g,用去离子水定容至100mL,pH7.4,高压除菌或0.22μm滤膜过 滤,无菌分装于褐色瓶内,4℃保存备用。 4.222倍浓度不含中性红MEM液:10倍浓度不含酚红的MEM20mL,胎牛血清4mL,青霉素和链 霉素各10000U(μg),去离水定容至100mL,0.22μm滤膜过滤,pH7.2~7.4,4℃保存备用。 4.23不含中性红的营养琼脂:使用前配制20g/L琼脂糖水浴融化后保持在43℃~45℃,加人等量 已加温至43℃~45℃的2倍浓度不含中性红MEM液,充分混合均匀,保存在43℃~45℃水浴中 备用。 4.242倍浓度含中性红MEM液:10倍浓度不含酚红的MEM20mL,胎牛血清4mL,青霉素和链霉 素各10000U(μg),中性红水溶液6mL.去离子水定容至100mL.0.22μm滤膜过滤,pH7.2~7.4, 4℃保存备用。 4.25含中性红的营养琼脂:使用前配制20g/L琼脂糖水浴融化后保持在43℃~45℃,加入等量已 加温至43℃~45℃的2倍浓度含中性红MEM液,充分混合均匀,保存在43℃~45℃水浴中备用。 4.260.1%过氧化氢。 4.27BSA:一般是在购置PCR试剂中带的,是在反应时保持酶活性的。不是必须的。不用自已配置。 2 GB/T27518—2011 也可不加入反应中。 4.28 30.5mol/LpH9.6的碳酸盐缓冲液:碳酸钠0.32g,碳酸氢钠0.586g,加水溶解,定容至 2 00 mL. 4.29抗马IgM。 4.305%脱脂奶粉:5g的脱脂奶粉溶于100mL的PBS缓冲液中。 4.310.05%tween-20:吐温-20。 4.32辣根过氧化物酶结合的抗黄病毒单克隆抗体。 4.33 Rnase:RNA 酶(RNA polymerase)。 5器材和设备 5.124孔细胞培养板。 5. 2 296孔细胞培养板。 5.3 二氧化碳培养箱。 5. 4 普通冰箱和超低温冰箱:规格2℃~8℃,一20℃,一80℃。 研磨器/研钵。 5.5 5.6 离心机(规格≥15000g)。 5.7 荧光RT-PCR检测仪。 5.8 PCR 仪。 可调移液器。 5.9 5.10 电泳仪。 5. 11 细胞瓶。 5. 12 微型滤器:装有0.22μm滤膜,121℃高压15min。 5.13 5%脱脂乳封板。 6 WNV的分离 6.1实验室生物安全要求 实验室生物安全要求按照附录A执行。 6.2样本采集 疑似死于西尼罗病毒病的动物可考虑采集血液、血清、脑脊液或组织,其中组织样品可优先采取脑 组织和神经组织,其次可采集肾、脾和肝组织。 进行血样采集时避免使用阻碍PCR反应的肝素,可用抗凝剂EDTA采血。 6.3样本运输与储存 血清样本应冷藏,24h内运送至实验室(血清标本可在4℃存放1周,长期保存置一20℃或以下)。 其他样本送至实验室后,病毒分离样本应尽快进行接种分离,48h内进行接种的可置于4℃保存,如未 能接种应置一70℃或以下保存,避免反复冻融。 6.4样本处理 取感染样本送专业实验室检测,样本的储存和运输应保持在低于一70℃中 组织样本取1g~2g在无菌研磨器或研钵中,加5mL~10mL含10%胎牛血清的PBS溶液,磨 3
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